A história do FOPROP começou quando o professor José Raymundo Martins Romeo, que na época era reitor da UFF e presidente do Conselho de Reitores das Universidades Brasileiras (CRUB), lançou a proposta da criação de uma “Câmara de Pesquisa e Pós-graduação”.
O Fórum foi, então, criado com o objetivo de permitir uma melhor interação entre os pró-reitores da área e dar conta dos órgãos financiadores da pesquisa e da pós-graduação.
Quem assumiu a representação do Fórum foi o professor Joaquim Cardoso Lemos que, na época, integrava uma comissão que cuidava dos assuntos da pós-graduação da UFF.
A ideia tomou corpo e a primeira reunião foi realizada em Niterói, entre os dias 20 e 22 de março de 1985, sem qualquer formalidade e com a participação de pró-reitores de pesquisa e pós-graduação de diversas universidades.
Essa reunião passou a ser considerada o Primeiro Encontro Nacional de Pró-reitores de Pesquisa e Pós-graduação das Instituições de Ensino Superior Brasileiras (chamado na época de ENPROPP).
Ela selou a fundação do que mais tarde viria a ser o Fórum Nacional de Pró-reitores de Pesquisa e Pós-graduação das Instituições de Ensino Superior Brasileiras (FOPROP).
Hoje, esse encontro é realizado anualmente, com a participação dos Pró-reitores das Universidades brasileiras federais, estaduais, comunitárias e privadas, de modo a se ter um movimento forte em prol da pesquisa e pós-graduação nas Instituições de Ensino Superior.